Для установки своего ядра на хостинг, Вам потребуется сделать следующее
Переименуйте Ваше ядро в server.jar.
Загрузите его в основную папку сервера (там где расположены папки world, plugins и т.д).
В панели управления, в поле “Файл JAR” укажите server.jar.
Нажмите в нижней части страницы “Сохранить” и перезапустите сервер.